その警告は私も出ます。
しかし無視しても同期ツールは使えますから影響は今のところありません。
原因不明ですが、警告の出ない人もいるようです。

seventeenさんのクリスマスプレゼント？で
設定してたときは行けたんですが、、、

hopeさんの日本語のやつをDownloadしてみたら
警告でて来たので・・・あれ？ってなって
使えてるんなら問題なさそうですね

前バージョンの2.4.6.1では警告は出ませんでした。
開発中のマスターと2.4.7ブランチだと警告が出ます。
最新バージョン用の同期ツールはまだアップロードしていないようで、次回リリース時にアップロードするらしいです。
seventeenさんは警告が出ないようにするための裏技？的なものを知っていたようで、Issuesに投稿したら教えてくれました。実際に試してみたら警告は出ませんでした。
開発者のyzyrayさんによれば、現状気にしないで使用してくださいとのことです。
日本語版のほうが早くリリースされる場合は、警告が出ないようにしたいと思います。