この問題は過去にも取り上げられたことがあります。
「ポップアップウィンドウの非表示化について」
https://www.h-eba.jp/Lizzie/patio/patio.cgi?read=165&ukey=0

消す方法は無いということでしたが、現在はどうなのか私は知りません。

参考になりました。ありがとうございます。

この問題については、以前LizzieYzyの開発者に問い合わせたことがありましたが、変更は難しいということだったと思います。
最新版では、添付図のような機能が追加されています。これを使うか、またはカーソルキーの上下でも代用可能です。