megapackは2024年夏にリリースされて以来アップデートされていません。
https://github.com/wonsiks/BadukMegapack
各種エンジンはその時点のものですから、その頃には発売されていなかったRTX5060 を認識しないのは当然です。
LizzieYzyに最新のKatagoエンジンとnetwork(weightファイル)を同梱したものをグーグルドライブにあげました。これならRTX5060を認識すると思います。
https://drive.google.com/drive/folders/1Uu5gFPAjY-_yPz-laBsHq9uYv2OTy1gF
よろしければ、お使いください。使い方はトップページの「LizzieYzyの使い方」をご覧ください。

親切にありがとうございました。